Relações filogenéticas inesperadas do rato-do-cacau Callistomys pictus (Rodentia: Echimyidae)
Resumo
Callistomys pictus é um roedor equimídeo arborícola e o único representante vivente do seu gênero. É endêmico de uma região restrita na Mata Atlântica, no estado da Bahia, leste do Brasil. No presente trabalho utilizamos sequências de 4 genes para inferir a posição filogenética de Callistomys na família Echimyidae. Os resultados mostram que Callistomys forma um clado com o ratão-do-banhado semi-aquático (Myocastor) que ocorre nas regiões abertas no cone sul da América do Sul e com o rato terrestre Proechimys com ocorrência na Amazônia, mas a relação filogenética entre esses três gêneros é incerta. Esse clado é irmão de Thrichomys, um equimídeo terrestre que ocupa as áreas áridas do centro da América do Sul. O agrupamento encontrado é inesperado, uma vez que seus membros apresentam aspectos morfológico, ecológicos e distribuição geográfica distintos e contrastantes. A filogenia resultante para a família Echimyidae indica que Callistomys não é proximamente relacionado aos outros equimídeos arborícolas e sugere que o hábito arborícolas evoluiu mais de uma vez nessa família.
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Referências
Adkins RM, Gelke EL, Rowe D, Honeycutt RL (2001) Molecular phylogeny and divergence time estimates for major rodent groups: evidence from multiple genes. Molecular Biolog y and Evolution 18: 777–791.
Bruford MW, Hanotte O, Brookfield JFY, Burke T (1992) Single-locus and DNA fingerprinting. In: Hoelzel AR (ed) Molecular Genetic Analyses of Populations: a pratical approach. Oxford, IRL Press, pp 225–269.
Candela AM, Rasia LL (2012) Tooth morphology of Echimyidae (Rodentia, Caviomorpha): homology assessments, fossils, and evolution. Zoological Journal of the Linnean Society 164: 451–480.
Carvalho GAS, Salles LO (2004) Relationships among extant and fossil echimyids (Rodentia: Hystricognathi). Zoological Journal of the Linnean Society 142: 445–477.
Darriba D, Taboada GL, Doallo R, Posada D (2012) jModelTest 2: more models, new heuristics and parallel computing. Nature Methods 9: 772.
Dutra RP (2012) Roedores do Quaternário de Minas Gerais e Bahia, Brasil. Dissertação de Mestrado. Programa de Pós-Graduação em Ecologia, Conservação e Manejo da Vida Silvestre, Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG), Belo Horizonte, MG.
Emmons LH (2005) A revision of the genera of arboreal Echimyidae (Rodentia: Echimyidae, Echimyinae) with the description of two new genera. In: Lacey EA, Myers P (ed) Mammalian Diversification: from chromosomes to phylogeography (a celebration of the career of James L. Patton). Berkeley, University of California Press, pp 247–309.
Emmons LH, Vucetich MG (1998) The Identity of Winge’s Lasiuromys villosus and the description of a new genus of echimyid rodent (Rodentia: Echimyidae). American Museum Novitates 3223: 1–12.
Fabre P-H, Galewski T, Tilak M, Douzery EJP (2013) Diversification of South American spiny rats (Echimyidae): a multigene phylogenetic approach. Zoologica Scripta 42: 117–134.
Galewski T, Mauffrey J-F, Leite YLR, Patton JL, Douzery EJP (2005) Ecomorphological diversification among South American spiny rats (Rodentia; Echimyidae): a phylogenetic and chronological approach. Molecular Phylogenetics and Evolution 34: 601–615.
Guindon S, Gascuel O (2003) A simple, fast and accurate method to estimate large phylogenies by maximum-likelihood. Systematic Biolog y 52: 696–704.
Huchon D, Catzeflis FM, Douzery EJ (1999) Molecular evolution of the nuclear von Willebrand factor gene in mammals and the phylogeny of rodents. Molecular Biolog y and Evolution 16: 577–589.
Leite YLR, Patton JL (2002) Evolution of South American spiny rats (Rodentia, Echimyidae): the star-phylogeny hypothesis revisited. Molecular Phylogenetics and Evolution 25: 455–464.
Moura RT, Fonseca GAB (2008) Callistomys pictus. The IUCN Red List of Threatened Species. Version 2014.2. . Downloaded on 13 September 2014.
Patterson BD, Velazco PM (2008) Phylogeny of the rodent genus Isothrix (Hystricognathi, Echimyidae) and its diversification in Amazonia and the eastern Andes. Journal of Mammalian Evolution 15: 181–201.
Ronquist F, Teslenko M, van der Mark P, Ayres DL, Darling A, Höhna S, Larget B, Liu L, Suchard MA, Huelsenbeck JP (2012) MrBayes 3.2: efficient Bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space. Systematic Biolog y 61: 539–542.
Shimodaira H (2002) An approximately unbiased test of phylogenetic tree selection. Systematic Biolog y, 51: 492–508.
Shimodaira H, Hasegawa M (2001) CONSEL: for assessing the confidence of phylogenetic tree selection. Bioinformatics 17: 1246–1247.
Smith MF, Patton JL (1993) The diversification of South American murid rodents: evidence from mitochondrial DNA sequence data for the akodontine tribe. Biological Journal of the Linnean Society 50: 149–177.
Swofford DL (2002) PAUP*: Phylogenetic Analysis Using Parsimony (and others methods). Sunderland, Sinauer Associates.
Teeling EC, Scally M, Kao DJ, Romagnoli ML, Springer MS, Stanhope MJ (2000) Molecular evidence regarding the origin of echolocation and flight in bats. Nature 403: 188–192.
Upham NS, Ojala-Barbour R, Brito MJ, Velazco PM, Patterson BD (2013) Transitions between Andean and Amazonian centers of endemism in the radiation of some arboreal rodents. BMC Evolutionary Biolog y 13: 1–24.
Upham NS, Patterson BD (2012) Diversification and biogeography of the Neotropical caviomorph lineage Octodontoidea (Rodentia:Hystricognathi). Molecular Phylogenetics and Evolution 63: 417–29.
Vaz SM (2002) Sobre a ocorrência de Callistomys pictus (Pictet) (Rodentia,Echimyidae). Revista Brasileira de Zoologia 19: 631–635.
Ventura K, Iack-Ximenes GE, Pardini R, Sousa MAN, Yonenaga-Yassuda Y, Silva MJJ (2008) Karyotypic analyses and morphological comments on the endemic and endangered Brazilian painted tree rat Callistomys pictus (Rodentia, Echimyidae). Genetics and Molecular Biolog y 31: 697–703.
Woods CA, Kilpatrick CW (2005) Suborder Hystricognathi. In: Wilson DE, Reeder DM (ed) Mammal Species of the World: a taxonomic and geographic reference. 2nd ed. Baltimore, Johns Hopkins University Press, pp 1538–1600.
Xia X (2013) DAMBE 5: A comprehensive software package for data analysis in molecular biology and evolution. Molecular Biolog y and Evolution 30: 1720–1728.
Xia X, Xie Z, Li WH (2003) Effects of GC content and mutational pressure on the lengths of exons and coding sequences. Journal of Molecular Evolution 56: 362–370.
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